El biotecnólogo César de la Fuente, uno de los 50 españoles más galardonados y considerado uno de los diez mejores del mundo, es pionero en el campo de la biología digital o machine biology, una tecnología que investiga la biología molecular a través de la inteligencia artificial para llegar a nuevos descubrimientos.
Ese fue vuestro primer proyecto de
biología digital sí crear con un
ordenador crear el primer antibiótico
qué Qué antibiótico de Qué antibiótico
estamos hablando Pues mira lo que
hicimos es empezamos
con empezamos con moléculas de la
naturaleza eh pequeñas proteínas de la
naturaleza y las codificamos en un en
ordenador no Entonces lo primero que
tuvimos que hacer es Cómo codificamos la
complejidad química de estas moléculas
en un lenguaje que el ordenador entienda
entonces tuvimos que averiguar eso eem y
luego eh una vez que le describimos al
ordenador lo que son estas moléculas
Cómo podemos hacer para que la máquina
eh las convierta en grandes antibióticos
no que maten a bacterias Esa era la
pregunta y para hacer eso había que
crear mucha diversidad a nivel molecular
y junto con nuestros colaboradores
durante mucho tiempo pensamos eh Cómo
hacer esto no Cómo crear Cómo innovar a
nivel molecular en la máquina en el
ordenador y después de pensarlo mucho
pues decidimos
e copiar un poco o mimetizar el proceso
el mejor la mejor herramienta que
tenemos para crear
Innovación a cualquier nivel y si lo
piensas eh Qué es el mejor la mejor
herramienta que existe o el mejor
proceso que existe para
crear para innovar o para crear
diversidad a cualquier nivel qué te
viene a la
cabeza me Pon un un brete Cuál es la
mejor herramienta para crear diversidad
Sí cómo hemos Cómo el ser humano Cómo
Hemos llegado a a ser lo que somos hoy
en
día la supervivencia no Darwin eso
exactamente o sea el proceso evolutivo
no la evolución el proceso evolutivo es
lo que a través de crear diversidad e
innovar a nivel de organismo a nivel
molecular pues nos ha permitido llegar a
donde estamos hoy no Homo Sapiens al ser
humano entonces decidimos pues
simplemente pues bueno si si Charles
Darwin se inventó esto pues pues bueno
vamos a intentar mimetizar un poco ese
proceso en el ordenador
Entonces el proceso fundamental de la
evolución es mutación selección y
recombinación quizás te acuerdes de de
la los cursos de biología del instituto
me está queriendo sonar coñecemento
medio coe Sí coe coe sí sí gran gran
asignatura me gustó mucho la verdad sí a
mí me gustaba mucho también porque había
muchos dibujos y eran los libros eran
muy bonitos los libros de coñ en todo
medio lo abrías y veías una mariposa
enorme y Y entonces qué era lo era
mutación mutación recombinación
y mutación selección y recombinación o
sea primero mutas haces un cambio en la
en el código
no del código genético eh después
selecciona eh seleccionas Y luego puedes
recombinar recombinar es juntar o sea
juntar diferentes partes del de la
molécula Ajá Y al final Bueno es un poco
lo que estás haciendo No e Y entonces le
enseñamos a la máquina a hacer esto con
las moléculas que le que que le dimos al
principio luego la máquina eh las
evoluciona prueba y error y luego eh
selecciona hace un ranking y selecciona
las las que predice que van a ser las
mejores antibióticos no que maten a
bacterias Eh entonces bueno llegamos a
ese punto en el proyecto y y y luego
Bueno sobre todo de aquella empezamos
este proyecto yo creo que en 2015 eh eh
No podíamos fiarnos de los ordenadores
Incluso hoy en día no podemos fiarnos
demasiado de los ordenadores pero de
aquella pues incluso más no entonces e
teníamos que validar todo
experimentalmente era el siguiente paso
del proyecto
eh Y entonces lo que hicimos fue Eh
sintetizamos muchas de esas moléculas en
el laboratorio usando métodos químicos
podemos crear estas moléculas que el
ordenador ha diseñado eh Y podemos
testar losos contra bacterias en en
experimentos en el laboratorio tenemos
acceso a bacterias superbacterias que
son relevantes clínicamente y podemos
eh tratarlas con las moléculas que crea
el ordenador para ver si realmente son
capaces de matarlas no a las
superbacterias
Y eso es lo que hicimos eh aquí pensamos
que iba ibamos a fracasar de nuevo eh
Porque dijimos Bueno una cosa es que el
ordenador crea la probabilidad de que
luego realmente sea activa en en
experimentos Pues bueno no es muy alta
no pero fuimos capaces de encontrar eh
algunas de las moléculas que el
ordenador creo fueron capaces de matar
completamente a a las bacterias en
cultivos celulares Ajá en en laboratorio
Y entonces ahí dijimos Wow increíble no
eh Y luego eh en lo que y y y la muchas
de las moléculas de la naturaleza venían
de plantas me decías de dónde vienen
venían de de plantas no del del mundo
natural eh Y luego decidimos un
experimento muy curioso decidimos eh
hacer la pregunta de cómo exactamente
están matando a las bacterias Cuál es el
mecanismo de acción que emplean no sobre
todo la la molécula mejor que
encontramos que la llamamos guab Nina
porque viene de la planta de la de la
guava
e y de Qué planta es esa es unaa así
planta
Tropical hay jugos o zumos de de guava
que está muy rico Ah vale por ahí por
por latinoamérica e y y hicimos esto y y
nos encontramos una cosa super curiosa
que era que los antibióticos e que son
similares a este que que creó el
ordenador
eh descritos previamente mataban a las
bacterias de una manera muy diferente a
lo de la guanina lo de esta molécula
antibióticos que sí existen y se
comercializan que sí existen y se
comercializan estos tien un mecanismo de
acción muy diferente eh a los que
encontramos en esta otra molécula que
era dar por ordenador y Esto fue un
experimento que cuando publicamos el
artículo
eh No supimos explicar este fenómeno no
de Por qué era tan diferente porque eso
era algo que no habíamos escrito en la
en el algoritmo y era mejor o peor era
diferente simplemente vale opuesto de
hecho lo opuesto y lo curioso es que
como no lo habíamos escrito en el
algoritmo no supimos explicarlo en el
artículo Por qué Por qué el algoritmo ha
seleccionado una molécula que mata las
bacterias de esta manera tan rara No tan
diferente y luego pensándolo ese
artículo lo publicamos en 2018 al final
eh pero hace unos meses pensando en este
experimento yo creo que quizás fue uno
de los primeros
eh uno de los primeros ejemplos de las
capacidades emergentes de la
Inteligencia artificial en la
biología porque hoy en día eh vemos
capacidades emergentes en los chatbots y
no que que crean cosas diferentes No a
lo que a lo que se prevé pero en la
biología quizás este experimento fue uno
de los uno de los primeros no quizás
donde algo que no habíamos escrito en el
algoritmo los programadores humanos no
habían escrito eh o dirigido al
algoritmo ningún de ninguna manera para
ir hacia ese mecanismo de acción pero el
la máquina pues creó algo completamente
nuevo Entonces esto nos dice que las
máquinas pueden ser capaces de de crear
cosas
originales y de tener cierto elemento de
creatividad un poco por prueba y error
pero pueden llegar a a crear algo nuevo
es es un concepto la verdad super
interesante no para pensar a nivel
filosófico también
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